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【paperhub】专文——版本动态与使用者情况--v0.51--内测
版本路线表 版本号 更新日期 重要改动备注 v0.10 20141102 创建 v0.11 20141104 容错性与友好性 v0.12 20141105 友好性 v0.13 20141116 友好性 v0.20 20141117 功能：集中打包下载 v0.21 20141120 容错性与友好性 v0.22 20141123 bug fix v0.30 20141125 功能：参考文献格式生成 v0.31 20141126 功能扩展 v0.32 20150113 功能扩展 v0.40 20150321 功能扩展:RIS解析 v0.41 20150402 容错性:新文章命名 v0.42 20150403 bug fix: ris结尾解析 v0.43 20150424 bug fix: ris关键词解析 v0.44 20150519 bug fix: Journal short解析 v0.50 20150714 重要功能扩展 v0.51 20150728 功能扩展； bug fix: record尸体处理 早就有计划做一个服务器端的文献管理、共享和备份的资料库，由于最近要开始大量阅读文献，再也受不了随意乱放的pdf。终于被逼做这件事情了，花了一整天的时间完成v0.01，距离最终理想目标还太远太远，但v0.01已经能够实现最基本的核心功能，只写了四个php文件加一个期刊简写的ascii文件，数据仓储直接用目录+enw实现，毕竟重要的还是文件名归类和云端备份，这两点都实现了。
目前实现的功能：
- 上传google生成的endnote导入enw文件
- 解析enw文件结构，生成唯一标志的文件名
- 在enw文件中写入url及label，直接打开导入endnote
- 上传对应的pdf文件
- 采用唯一标志的文件名命名enw文件与pdf文件于仓储目录
测试：
1.从google获得enw导入文件
2.上传enw文件到Lab服务器
3.solve_enw.php解析enw文件并生成唯一标志的文件名，写url和label信息进入enw文件，并提供重新导出：
4.上传对应pdf文件，并命名唯一化，唯一化命名可以在本地同样使用：
5.enw和pdf命名唯一化后放入仓库：
6.可以直接通过endnote中的url打开Lab服务器的在线文件：
毕竟是v0.01，输入没有做合法性检查，美工几乎没有，距离自动通过doi进行解析下载以及引文信息生成还差太远。将来如果要实现类似endnote那种方便的查询增删功能，而且如果要共享涉及到账户用户权限的问题，不用关系数据库是不可能的，目前这种单纯用目录组织数据结构肯定行不通，可是mySQL一窍不通，我还是太水了，有空闲下来再慢慢玩吧，现在功能对我个人基本够用:-)
#Up to 20141102#
【注】文件名唯一标志：
%A1-%J-%V_%N_%Ps-%Pe
第一作者-期刊（简写）-卷号_期号_起始页-终了页
Giannini-Science-2003-302_5647_1027-1030
#Up to 20141103#
考虑到工程量不大，决定重新命名版本号：
- miner mod (细微更改) 占用第二位小数，例如友好性提高
- major mod (重要更改) 占据第一位小数，例如功能添加
- kernel mod (内核更改) 占据个位数字，例如新技术的引入（mySQL、R等），数据库结构调整，正式发布版本等。
目前最新版本为
v0.11
Miner Mods：
- 增加了对仓储的重复性检查，仓储数据列表位于list.dat中，提高容错性与健壮性
- 考虑了对仅有vol编号或者doi编号的文献命名的，提高容错性与健壮性
- 在个别页面增加了主页跳转链接，提高用户友好性
今天花了一个多小时时间，上传了80多篇文献，命名全部归一化，enw全部生成完毕，随时可以导入endnote。比起之前第一次手工整理时的效率，还是提升了很多的。
考虑：加入以日期命名的enw生成目录，以便将来定期整理文献时方便导入endnote。
#Up to 20141104#
v0.12
今天增加了一些更为客户友好的操作，提高文献归库效率
Miner Mods：
- 增加按日期命名的record目录，方便用户集中下载当日整理过的enw文件导入endnote
- 采用file_get_contents函数直接勾取google的enw文件，免除用户先下载后上传的麻烦
- 采用file_get_contents函数直接勾取pdf文件，免除用户先下载后上传的麻烦
- 在个别页面增加了主页跳转链接，提高用户友好性
Show一张endnote导入后的截图
#Up to 20141105#
v0.13
增加更为客户友好的操作，提高文献归库效率
Miner Mod：
- 增加上传文献结束后直接进入文献的链接
#Up to 20141116#
v0.20
用了一晚上的时间进行了Major mod，终于可以升级一级版本号啦。增加了文献打包下载的功能，php调用一堆系统函数实现，我真是弱爆了，数据量大的时候估计效率会是个问题，不过还好，个人使用的情况绝不会动辄几百篇文献地down吧，考虑版本公开后不允许批量下载pdf，只可以下载enw。目前计划公开版的版本本号为v1.xx
增加的文件：
package.php
package_down.php
打包页面示例：
Major Mod：
- 增加集中打包下载的功能
（提醒：需要加入文献删除功能了）
#Up to 20141117#
v0.21
Miner Mods：
- 增加了文献名模糊匹配搜索（子串匹配，大小写不敏感），提高文献归库效率
- 重复提交的文献提供旧文件链接，用户友好。
#Up to 20141120#
v0.22
Miner Mods：
- 修正集中打包下载buffer bug
#Up to 20141123#
v0.30
晚上画图，ncl出图太慢，间隙用来给paperhub加入文献格式生成的功能，加着加着就忘了画图了，索性今天搞定这个major mod。目前仅仅对 paper to be submitted to Climate Dynamics进行了设置。引入了1页php和一个针对CD的期刊名缩略库short_ref_cd.dat。每增加一个submit的期刊就要引入一个缩略库，目前在没有办法将数据封装到json或者用关系数据库的情况下只能这样，当然也只能作为个权宜之计，以后submit的文章多了（如果能办到的话～），一堆文件看着都头疼……寒假如果可以的话，学学R，把组织格式shift到json上。
Major Mods：
- 加入针对投稿期刊的参考文献样式自动生成，目前仅针对Climate Dynamics，考虑到中文名缩写问题，生成first name缩写与不缩写两种形式，正式写入文章时需要调整下
范例图
index.php输入生成的唯一标志符，然后通过目录查询找到文件，解析enw生成参考文献格式Chou Chia, Neelin J David (2004) Mechanisms of global warming impacts on regional tropical precipitation*. J Clim 17: 2688-2701. Chou C, Neelin JD (2004) Mechanisms of global warming impacts on regional tropical precipitation*. J Clim 17: 2688-2701.#Up to 20141125#
v0.31
Minor Mods：
- 加入针对JC的参考文献样式自动生成
#Up to 20141126#
v0.32
Minor Mods：
- 加入文献本地pdf附件的链接
#Up to 20150113#
v0.40
Major Mods：
- 加入对RIS格式记录的解析与支持，重写了solve_enw.php核心函数，加入对RIS标志字段识别与解析，默认存储格式取决于输入格式（RIS-->RIS,enw-->enw）
#Up to 20150321#
v0.41
Minor Mods：
- 加入对online但未定vol/number/page文章的命名考虑，规则：
$author, $journal, strrev($year0)首字母ASCII码决定。范例：
Huang-GCB-2015-fv72_fn71_fp53.pdf
#Up to 20150402#
v0.42
Minor Mods：
- BUG FIX: 修正了对RIS结尾标志符的判断问题
#Up to 20150403#
v0.43
Minor Mods：
- BUG FIX: 修正了对RIS某类期刊关键词标志符的判断问题
#Up to 20150426#
v0.44
Minor Mods：
- BUG FIX: 修正了对Nature子刊ris中对short term解析的问题
#Up to 20150519#
v0.50
要写文章，paperhub要更舒服才有动力！两天时间做了几处大改动。
Major Mods：
- 增加了对ris的参考文献格式生成
- 增加了对多行记录的参考文件格式生成
- 修改打包算法，按修改时间排序，直接在warehouse中选择操作，减少了record额外记录空间，并且能够精确定位文章
- 增加warehouse下僵尸记录检测删除，每次打开index.php自动检测
#Up to 20150714#
v0.51
Minor Mods：
- BUG FIX: 修正了对upload_page.php 中对record尸体目录的操作
- 功能扩展：集中打包页面更改为管理页面，增加记录删除功能，列表增加<a>标签指向warehouse文献pdf
#Up to 20150519#
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【已解决】Wordpress按修改顺序排列文章
确实按修改时间排序才是比较符合一般人浏览习惯的，（原来除了我之外还有其他读者呀，好感动，不介意就冒个泡呗，留个nickname+邮箱就好，嘿嘿）查了下，改index.php下的loop中的一个属性即可，加在while主循环之前，主循环后再来个wp_reset_query();即可。粗体标注更改属性：
$paged = (get_query_var('paged')) ? get_query_var('paged') : 1; $args = array('orderby'=>modified, 'showposts'=>10, 'paged'=> $paged ); query_posts($args);
【参考资料】
http://i7298.com/archives/55
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【已解决】利用php函数强制下载链接（即不允许浏览器打开文本文件）
今天做paperhub v0.01的时候，生成的enw文件会自动在浏览器中打开，而我们希望能够采用下载的形式在endnote中打开。百度了下，解决方法原来可以直接用php去修改html请求头:
$filename = '/path/'.$_GET['file'].'.txt'; //文件路径 header("Content-Type: application/force-download"); header("Content-Disposition: attachment; filename=".basename($filename)); readfile($filename);
最初写在了solve_enw.php中，结果是整个页面的html流都返回了，原来是这样。于是又建立了一个down_enw.php文件，不输出html流，可以正常下载enw文件。
参考资料：
http://www.jb51.net/article/26907.htm
- A bit of experience and bitter reflection from my visit to CD
- 货币的价值
- 2018年2月5日“波动性末日”（Volmageddon）的回顾与思考
- 24年10月市场观察
- EGU23-10723 Supplementary Materials: Mangkhut (2018)
- Intel MPI specified compiler
- git submodules
- PYROMS Installation
- Coursera Machine Learning : W9 Anomaly Detection
- PGI21 WRF-CMAQ 2WAY