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Wind extinguishes a candle but energizes fire.

【已解决】ncl中关于Land Sea Mask的问题

2014-11-22

LZN

science

ncl land_sea_mask
模式中为了防止海陆边界不连续造成积分不稳定，往往会将海温插值到陆地上，画图时当然不希望这些数据出现，求海温区域平均时也不希望出现，所以必须要处理下。根据目的是画图还是计算，处理的方式不一样。画图的话，我们希望海陆边缘不要出现

比如这样就很好。其实不需对原数据进行操作，只要改变绘图的属性让地图底图后画就可以：
```
res@mpFillDrawOrder="PostDraw"
```
如果要进行计算，就需要mask了，如果是规整的1x1的数据可以用landsea_mask解决
```
load "$NCARG_ROOT/lib/ncarg/nclscripts/csm/shea_util.ncl"
```
```
a    = addfile("$NCARG_ROOT/lib/ncarg/data/cdf/landsea.nc","r")
lsdata = a->LSMASK
lsm  = landsea_mask(lsdata,data&lat,data&lon)
data = mask(data,lsm.eq.1,False)
data = mask(data,lsm.eq.3,False)
```
如果数据不是规整的1x1，需要先做一下插值处理，比如包含极点的场变量转换
```
 var4    = f2fsh_Wrap(var4s1,(/180,360/))
```
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【已解决】Adobe Acrobat X安装

2014-11-17

LZN

technology

windows acrobat

Acrobat X安装后出现Adobe Application Manager损坏的问题，安装包下有个amtlib.dll的动态链接库，复制到安装路径的根目录下即可解决问题。至此，Acrobat+Illustrator已经占据paper reading & producing阵地，reading再有paperhub和endnote的助阵，终于把看文献的前期工作准备好了嗯～接下来……T_T

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【已解决】CAM_F05 Resolution Out of Memory

2014-11-08

LZN

science

cesm cam hardware hpc linux

之前在天河二号（包括学校超算集群）测试的F05的CAM，都没有出现什么问题，最近在天河二号上重新跑CAM5 F05，却出现了out of memory的错误，重新配置了CAM4，还是一样的错误：

Fatal error in PMPI_Alltoallv: Other MPI error, error stack: PMPI_Alltoallv(540)....................: MPI_Alltoallv(sbuf=0x806f43e0, scnts=0xe6c75e0, sdispls=0xe764390, dtype=0x4c000829, rbuf=0x805f7650, rcnts=0xe765ba0, rdispls=0xe7673b0, dtype=0x4c000829, comm=0x84000006) failed MPIR_Alltoallv_impl(378)...............: MPIR_Alltoallv(341)....................: MPIR_Alltoallv_intra(192)..............: MPIC_Waitall(720)......................: MPIR_Waitall_impl(163).................: MPIDI_CH3I_Progress(363)...............: MPID_nem_mpich_blocking_recv(906)......: MPID_nem_glex_poll(234)................: MPIDI_nem_glex_ER_progress_PUT(74).....: MPIDI_nem_glex_ER_recv_progress(378)...: MPID_nem_handle_pkt(635)...............: MPIDI_CH3_PktHandler_EagerSend(640)....: failure occurred while posting a receive for message data (MPIDI_CH3_PKT_EAGER_SEND)

重新配置PE层，增多节点数，调整MPIBUFFER，都没用。目前搁置。forum上有贴子：

https://bb.cgd.ucar.edu/node/1001941

eaton提到检查内存leak can be a very challenging exercise.

#Up to 20141108#

俊文寒假前将model统一升级到1.2.2后似乎没有这个问题了。不过我也退出折腾高分辨率啦，还是看paper学英语重要～嘿嘿

#Up to 20150519#

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【已解决】CAM_F05 Resolution Out of Memory